Marcin Warchoł w latach 2006–2007 był asystentem ministra sprawiedliwości Zbigniewa Ziobry, a w latach 2009–2010 asystentem Janusza Kochanowskiego – ówczesnego Rzecznika Praw Obywatelskich. W biurze RPO pracował do 2015 roku, skąd trafił do Ministerstwa Sprawiedliwości. W VIII kadencji Sejmu był doradcą Klubu Poselskiego Ruch Palikota.